En ese sentido, la Comisión Nacional del Agua y el Gobierno del Estado, promueve la consolidación y el desarrollo de los consejos de cuenca, mediante la instalación de las Gerencias Operativas en los Comités Técnicos de Aguas Subterráneas, con la finalidad de que estos organismos cuenten con una oficina, equipamiento y personal técnico-administrativo que permitan consolidar la participación de los usuarios en el manejo del agua a nivel cuenca y acuífero, mediante el apoyo de las actividades operativas, estudios proyectos y acciones de los COTAS, para el aprovechamiento de las Aguas Subterráneas consecionadas.
Los Comités Técnicos de Aguas Subterráneas, están conformadas por representantes de los diversos Usos del Agua en los Acuíferos, con la finalidad de buscar el Aprovechamiento Sustentable del Recurso Hídrico, así como las acciones a realizar para la recuperación de los mismos.
Convenios de Colaboración
Para que el Gobierno del Estado de Baja California, aporte recursos económicos a los Cotas y los conjunte con recursos del Gobierno Federal a través de la Comision Nacional del Agua, esto se realiza mediante un Convenio de colaboración y un Anexo Técnico del Convenio.
Propósito:
Establecer que la aportación de los recursos que hacen el Gobierno Federal y Estatal, se destinan para apoyar actividades operativas, estudios, proyectos y acciones que son aprobados en el propio convenio.

• Promoción e instalación de los Medidores Volumétricos.
• Elaboración y/o actualización del censo técnico administrativo del acuífero.
• Relación o inventario de estudios y proyectos específicos a nivel acuífero.
• Elaboración de estudios tendientes al establecimiento de una red de piezometria para Conocer los niveles del acuífero y determinar la capacidad del mismo.
• Elaboración de estudios tendientes al establecimiento de una red de estaciones metereológicas para determinar los niveles de recarga.
• Llevar a cabo asambleas periódicas antes sus usuarios para darles a conocer el programa los avances y resultados y que acciones se tiene que adoptar para reducir la sobreexplotación y el manejo Sustentable del Agua.
• Elaborar el programa de gestión para el uso sustentable del agua.